在貴州普定縣西南，有一處獨特的南北對穿洞穴——穿洞遺址。這里曾歷經多次考古發掘，最近一次由貴州省文物考古研究所聯合中國科學院古脊椎動物與古人類研究所，在2022年至2025年期間展開，為期三年，取得了令人矚目的成果。

此次發掘共設立了四個發掘區，總面積約50平方米。研究顯示，北洞口堆積狀況不佳，文化遺物稀少；而南洞口則保存較好，特別是S2和S3區域。S4區域的發掘揭示了洞廳晚期文化層的缺失，可能與清代晚期當地人的活動有關，但其下層堆積保存良好，年代對應S3區的⑧層以下。

穿洞遺址的文化堆積厚度超過6米，時間跨度從距今約8萬年至8000年，涵蓋了舊石器時代中期至新石器時代。這一連續的文化堆積在全國范圍內極為罕見，為研究該區域的歷史提供了豐富的實物資料。遺址內發現了3座墓葬、1萬余件石制品、2500余件骨角制品、10萬余件動物骨骼，以及少量與人類活動相關的植物遺存。

在發掘過程中，考古團隊采用了精細化的發掘方法，如布設1米×1米的探方，按照自然層位控制發掘，并在同一自然層內采用2厘米水平層向下發掘。所有尺寸超過2厘米且與人類活動相關的遺物都被測量三維坐標后逐層收集，確保了對人類活動信息的全面提取。通過這些方法，發現了大量骨器、裝飾品和人類化石等重要遺物。

穿洞遺址的文化堆積可分為四期。第一期距今約8萬年，人類活動較少，僅出土了2件石制品和部分哺乳動物化石。第二期距今約6萬至7萬年，發現了晚期智人臼齒化石1顆，遺物主要為石制品和動物化石。第三期距今約5萬至1.2萬年，遺跡和遺物豐富，包括灰坑、用火遺跡和骨堆等。第四期距今約1.2萬至8000年，是人類活動最頻繁的時期，石質工具數量明顯增多，骨角制品大量出現。

此次發掘還修正了對穿洞遺址年代框架的認識，將其上限上溯至距今約8萬年。出土的石制品加深了對該遺址石器工業的認知，呈現出更高的多樣性和復雜性。石制品原料以巖塊和礫石為主，類型包括石核、石片、碎屑、斷塊和工具等。工具可分為刮削器、尖狀器、石錛等多種類型。特別是第三期，在距今3.7萬年至3.3萬年的層位中發現了目前中國最早的窄槽礪石。

遺址中出土的赭石相關遺存為探討古人類對赭石的利用行為提供了多元證據。地層中出土了大量赭石塊，部分呈現出集中分布的現象，表明其與古人類有意識的采集行為相關。同時，還發現了加工、利用赭石的實物證據，如表面附著赭石粉末的穿孔裝飾品等。

穿洞遺址還出土了大量骨角工具和裝飾品，包括2500余件骨角器，其中有明顯刮削、磨制、拋光或刻槽等技術特征的磨制類骨角工具1500件。這些骨制品類型和數量的層位變化揭示了生業模式的歷時性變化。骨質和貝殼質串珠的發現為探索史前藝術行為提供了素材。

遺址中還首次發現了豪豬、竹鼠、象、牛、鳥、龜、魚等動物遺存，這些遺存在闡釋區域古氣候環境背景、穿洞古人類生業模式及其動態歷時性變化方面具有重要學術價值。同時，在距今約1萬年的地層中出土了部分炭化的獼猴桃屬及藜屬植物種子，這些物種很可能為穿洞遺址古人類采集活動的重要對象。

穿洞遺址是中國南方地區首個同時出土舊石器時代中期、晚期古人類化石與舊—新石器時代過渡階段墓葬遺存的遺址。其中，第?層出土的1顆早期現代人臼齒化石填補了貴州地區該時段古人類遺存的空白。舊—新石器時代過渡階段發現的3座特殊墓葬行為，出土的人類骨骼包括未成年人下頜和成年人顱骨，隨葬品共出5件。這些墓葬及人骨的發現為研究該地區史前人類體質特征、遺傳信息及埋葬習俗提供了重要資料。