字節跳動在生物計算領域投下一枚重磅“炸彈”——正式推出全開源生物分子結構預測模型Protenix-v1。該模型不僅完整復現了AlphaFold3（AF3）的核心功能，更通過Apache2.0協議全面開放代碼與模型參數，為全球科研人員打開頂尖生物大模型的技術大門，推動行業進入開放協作的新階段。
Protenix-v1的核心突破在于其全原子3D結構預測能力。該模型可同時處理蛋白質、核酸（DNA與RNA）及小分子配體等復雜生物系統，實現從單一分子到多組分交互的高精度建模。據第三方評測平臺AIbase披露，在相同訓練數據規模、模型參數量及計算資源條件下，Protenix-v1在多項基準測試中表現優于AlphaFold3，成為全球首個達到這一水平的全開源模型。
為確保評估的客觀性與可復現性，字節跳動同步發布PXMeter v1.0.0評測工具箱。該工具箱包含超過6000個高難度分子樣本，覆蓋蛋白質折疊、核酸-配體結合等關鍵場景，為行業提供標準化測試基準。項目團隊還開發了基于瀏覽器的交互式Web服務器，科研人員無需本地部署即可在線運行模型、可視化預測結果，大幅降低技術使用門檻。
業內專家指出，Protenix-v1的開源將重塑生物計算領域的研究范式。傳統藥物研發中，分子結構預測需耗費數月時間與高額成本，而該模型的開放將使全球實驗室快速驗證假設、優化設計方案。在合成生物學領域，研究人員可基于模型預測設計新型酶或代謝通路，加速從實驗室到產業化的轉化進程。這一突破或成為推動生命科學基礎研究與應用開發的關鍵引擎。
